home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ MacWorld: Complete Mac Interactive / Macworld Complete Mac Interactive CD)(1994).iso / Software / More Shareware⁄Freeware / NIH Image 1.55 f (non fpu) / Macros / Input⁄Output Macros < prev    next >
Text File  |  1994-04-19  |  14KB  |  554 lines
  1. var
  2.   CharLoc:integer; {Global variable, initially zero}
  3.  
  4. macro 'Save using Time as Name…';
  5. {Note: Colons are not allowed in file names.}
  6. var
  7.   year,month,day,hour,minute,second,DayOfWeek:integer;
  8. begin
  9.   GetTime(year,month,day,hour,minute,second,DayOfWeek);
  10.   SaveAs(year-1900:2,'-',month:2,'-',day:2,
  11.          '/',hour:2,'-'minute:2,'-',second:2);
  12. end;
  13.  
  14.  
  15. macro 'Open with selection… [O]';
  16. begin
  17.   if nPics>0 then KillRoi; {Save Selection}
  18.   Open('');                {Prompt for file name}
  19.   RestoreROI;              {Transfer selection to new window}
  20. end;
  21.  
  22.  
  23. macro 'Save All…';
  24. {
  25. Saves all currently open images in a folder using '001', '002', etc.
  26. as the file names. The save file dialog box will be displayed once
  27. (and only once) so that you can specify the folder to save the files in.
  28. Leave the file name blank(e.g. SaveAs('')) to get a dialog box for each file.
  29. }
  30. var
  31.   n:integer;
  32. begin
  33.   RequiresVersion(1.45);
  34.   for n:=1 to nPics do begin
  35.     SelectPic(n);
  36.     SaveAs(n:3);
  37.     {Export(n:3);}
  38.   end;
  39. end;
  40.  
  41.  
  42. macro 'Import FITS…';
  43. {
  44. Imports 8 and 16-bit FITS images. Refer to "FITS:A Flexible Image
  45. Transport System", Astronomy and Astrophysics Supplement
  46. Series 44, 1981, 363-370.
  47. }
  48. var
  49.   width,height,offset,HdrPid:integer;
  50.   recsize,maxrecs,maxlines,loc,i,line:integer;
  51.   BitPix,str:string;
  52. begin
  53.   RequiresVersion(1.52);
  54.   recsize:=2880;
  55.   maxrecs:=10; {Must be increased to handle headers longer than 360 lines.}
  56.   maxlines:=(recsize*maxrecs)/80;
  57.   width:=recsize; 
  58.   height:=maxrecs;
  59.   offset:=0;
  60.   SetImport('8-bit'); 
  61.   SetCustom(width,height,offset);
  62.   Import(''); {Read in header as an image, prompting for the file name.}
  63.   HdrPid:=PidNumber;
  64.   BitPix:=Concat(chr(GetPixel(108,0)),chr(GetPixel(109,0)));
  65.   if (BitPix<>' 8') and (BitPix<>'16') then begin
  66.     PutMessage('This macro only reads 8 and 16-bit FITS files');
  67.     SelectPic(HdrPid);
  68.     Dispose;
  69.     exit;
  70.   end;
  71.   str:=concat(chr(GetPixel(266,0)), chr(GetPixel(267,0)),
  72.     chr(GetPixel(268,0)), chr(GetPixel(269,0)));
  73.   width:=StringToNum(str);
  74.   str:=concat(chr(GetPixel(346,0)), chr(GetPixel(347,0)),
  75.     chr(GetPixel(348,0)), chr(GetPixel(349,0)));
  76.   height:=StringToNum(str);
  77.   loc:=0;
  78.   line:=0;
  79.   repeat
  80.     str:='';
  81.     for i:=1 to 3 do begin
  82.        str:=concat(str,chr(GetPixel(loc mod recsize, loc div recsize)));
  83.        loc:=loc+1;
  84.     end;
  85.     loc:=loc+77; {Skip to end of line}
  86.     line:=line+1;
  87.   until (line>=maxlines) or (str='END');
  88.   SelectPic(HdrPid);
  89.   Dispose;
  90.   offset:=recsize+recsize*((line*80) div recsize);
  91.   if BitPix=' 8'
  92.     then SetImport('8-bit')
  93.     else SetImport('16-bit Signed; Calibrate; Autoscale');
  94.   SetCustom(width,height,offset);
  95.   Import('');  {No prompt this time; Import remembers the name.}
  96.   if BitPix=' 8' then Invert;
  97.   FlipVertical;
  98. end;
  99.  
  100. macro 'Display FITS Header…';
  101. var
  102.   i,j,loc:integer;
  103.   HdrPid,RecordSize,maxlines,line:integer;
  104.   MaxRecords:integer;
  105.   wname,str:string;
  106. begin
  107.   RequiresVersion(1.53);
  108.   RecordSize:=2880;
  109.   MaxRecords:=10;
  110.   maxlines:=(RecordSize*MaxRecords)/80;
  111.   SetImport('8-bit'); 
  112.   SetCustom(RecordSize,10,0);
  113.   Import(''); {Read in header as an image, prompting for the file name.}
  114.   HdrPid:=PidNumber;
  115.   SetFont('Monaco');
  116.   SetFontSize(9);
  117.   wname:=concat(WindowTitle,' Header');
  118.   NewTextWindow(wname,500,500);
  119.   loc:=0;
  120.   line:=1;
  121.   repeat
  122.     ChoosePic(HdrPid);
  123.     str:='';
  124.     for j:=1 to 80 do begin
  125.        str:=concat(str,chr(GetPixel(loc mod RecordSize, loc div RecordSize)));
  126.        loc:=loc+1;
  127.     end;
  128.     SelectWindow(wname);
  129.     writeln(str);
  130.     line:=line+1;
  131.   until (line>maxlines) or (pos('END',str)=1);
  132.   SelectPic(HdrPid);
  133.   Dispose;
  134.  end;
  135.  
  136.  
  137. macro 'Import Image TIFF File…';
  138. {
  139. As an example of how to import a foreign file format, this macro reads
  140. the TIFF files created by Image. The format of an Image TIFF file
  141. is described in Appendix E of the Image manual.
  142. }  
  143. var
  144.   width,height,offset:integer;
  145. begin
  146.   width:=768; 
  147.   height:=1;
  148.   offset:=0;
  149.   SetImport('8-bit'); 
  150.   SetCustom(width,height,offset);
  151.   Import(''); {Read in header as an image, prompting for the file name.}
  152.   if not ((GetPixel(0,0)=77) and (GetPixel(0,0)=77)) then begin  {'MM'}
  153.     PutMessage('This is not a TIFF file.');
  154.     SelectPic(nPics); Dispose;
  155.     exit;
  156.   end;
  157.   width := (GetPixel(30,0)*256) + GetPixel(31,0);
  158.   height := (GetPixel(42,0)*256) + GetPixel(43,0);
  159.   SelectPic(nPics);  {The ID of the last window opened is equal to nPics.}
  160.   Dispose;
  161.   offset:=768;
  162.   SetCustom(width,height,offset);
  163.   Import('');  {No prompt this time; Import remembers the name.}
  164. end;
  165.  
  166.  
  167. macro 'Import Multiple Images per File…';
  168. {
  169. Imports a series of 256x256 images contained in a single file, in this
  170. case an NIH Image stack with an arbitrary number of 256x256 slices.
  171. }
  172. var
  173.   offset,i,PicSize,HdrSize,width,height:integer;
  174. begin
  175.   HdrSize:= 768;
  176.   width:= 256;
  177.   height:=256;
  178.   PicSize:=width*height;
  179.   offset:=HdrSize;
  180.   SetImport('8-bit');
  181.   for I:=1 to 100 do begin  {Macro will terminate at eof}
  182.     SetCustom(width,height,offset);
  183.     Import('');
  184.     offset:=offset+PicSize;
  185.   end;
  186. end;
  187.  
  188.  
  189. macro 'Import 3D PET…';
  190. var
  191.   offset,i,PicSize,HdrSize,width,height:integer;
  192. begin
  193.   HdrSize:= 0;
  194.   width:= 128;
  195.   height:=128;
  196.   PicSize:=width*height;
  197.   offset:=HdrSize;
  198.   SetImport('8-bit');
  199.   for I:=1 to 100 do begin  {Macro will terminate at eof}
  200.     SetCustom(width,height,offset);
  201.     Import('');
  202.     offset:=offset+PicSize;
  203.   end;
  204. end;
  205.  
  206.  
  207. macro 'Convert Files…';
  208. {
  209. Converts a set of raw data files(all in the same folder) with names
  210. in the form raw.001, raw.002, etc to TIFF or PICT.  As long as the
  211. converted files are saved in the same folder, you should
  212. only see two file dialog boxes(one for the first Import and one for
  213. the first SaveAs).
  214. }
  215. Var
  216.   i,nFiles:integer;
  217. begin
  218.   nFiles:=GetNumber('Number of files:',5);
  219.   for i:=1 to nFiles do begin
  220.     Import('raw.',i:3);
  221.     SetPicName('file',i:3);
  222.     SaveAs;
  223.     Dispose;
  224.   end;
  225. end;
  226.  
  227.  
  228. macro 'Import IPLab File';
  229. var
  230.    width,height,offset:integer;
  231. begin
  232.    width:=100; 
  233.    height:=1;
  234.    offset:=0;
  235.    SetImport('8-bit'); 
  236.    SetCustom(width,height,offset);
  237.    Import(''); {Read in header as an image, prompting for file name.}
  238.    width := (GetPixel(8,0)*256) + GetPixel(9,0);
  239.    height := (GetPixel(12,0)*256) + GetPixel(13,0);
  240.    Dispose;  
  241.    offset:=2120;  {The IPLab offset}
  242.    SetImport('16-bit Signed; Calibrate; Autoscale');
  243.    SetCustom(width,height,offset);
  244.    Import('');  {No prompt this time; Import remembers the name.}
  245. end;
  246.  
  247.  
  248. procedure ShowBioRadInfo;
  249. {Displays the contents of the 480(?) byte header at}
  250. {the end of Biorad MRC 600 Z Series files.}
  251. var
  252.   MaxInfoSize,offset:integer;
  253.   ch:string;
  254. begin
  255.   MaxInfoSize:=480;
  256.   SetCustom(MaxInfoSize,1,HdrSize+Width*Height);
  257.   SetImport('8-bit'); {Don't invert}
  258.   Import('');
  259.   GetRow(0,0,MaxInfoSize);
  260.   Dispose;
  261.   SetNewSize(460,100);
  262.   SetForeground(255);
  263.   SetBackground(0);
  264.   MakeNewWindow('Info');
  265.   SetCursor('Watch');
  266.   SetFont('Monaco');
  267.   SetText('With background; Left Justified');
  268.   SetFontSize(12);
  269.   MoveTo(8,10);
  270.   for i:=0 to MaxInfoSize-1 do begin
  271.     offset:=i mod 96;
  272.     if offset=0 then writeln;
  273.     ch:=chr(LineBuffer[i]);
  274.     if (offset=2) and (ord(ch)=0) then exit;
  275.     if (offset>=16) and (offset<=95) and (ord(ch)>=32) and (ord(ch)<=126)
  276.       then write(ch);
  277.   end;
  278. end;
  279.  
  280.  
  281. macro 'Import Biorad MRC 600 Z Series…';
  282. {
  283. Imports a Z series(multiple images per file) from a Biorad MRC 600
  284. confocal microscope.  The width, height and number of images are
  285. extracted from the first 3 16-bit word in the 76 byte header and
  286. the file name is extracted from bytes 18-23 of the header. This macro
  287. does not read merged pseudocolored BioRad files. Note that the Undo
  288. and Clipboard buffers must be set to 384K to work with the typical
  289. 768x512 Biorad images.
  290. }
  291. var
  292.   width,height,nImages,offset,hdrsize,i,start,picsize:integer;
  293. begin
  294.   RequiresVersion(1.50);
  295.   width:=512; 
  296.   height:=1;
  297.   offset:=0;
  298.   SetImport('8-bit'); 
  299.   SetCustom(width,height,offset);
  300.   Import(''); {Read header}
  301.   GetPicSize(width,height);
  302.   if (width<>512) or (height<>1) then begin
  303.     Dispose;
  304.     PutMessage('Please to not change width, height, etc. in the Import dialog box.');
  305.     exit;
  306.   end;
  307.   width:=GetPixel(0,0)+GetPixel(1,0)*256;
  308.   height:=GetPixel(2,0)+GetPixel(3,0)*256;
  309.   nImages:=GetPixel(4,0)+GetPixel(5,0)*256;
  310.   Dispose;
  311.   hdrsize:= 76;
  312.   picsize:=width*height;
  313.   if (width<128) or (width>2048) or (height<128) or (height>2048) or (nImages<1) or (nImages>256) then begin
  314.     PutMessage('This does not seem to be a Biorad MRC 600 Z Series file.');
  315.     exit;
  316.   end;
  317.   start:=GetNumber('Starting image:',1);
  318.   offset:=HdrSize+(start-1)*PicSize;
  319.   SetImport('8-bit, Invert');
  320.   SetCustom(width,height,offset,nimages);
  321.   Import('');
  322.  ShowBioRadInfo;
  323. end;
  324.  
  325.  
  326. macro 'Import from IBAS';
  327. var
  328.    width,height,offset:integer;
  329. begin
  330.    width:=128; 
  331.    height:=1;
  332.    offset:=0;
  333.    SetImport('8-bit'); 
  334.    SetCustom(width,height,offset);
  335.    Import(''); {Read in header as an image, prompting for file name.}
  336.    width := (GetPixel(7,0)*256) + GetPixel(6,0);
  337.    height := (GetPixel(9,0)*256) + GetPixel(8,0);
  338.    Dispose(nPics);  {The ID of the last window opened = nPics.}
  339.    offset:=128;  {The IBAS offset}
  340.    SetImport('8-bit; Calibrate; Autoscale');
  341.    SetCustom(width,height,offset);
  342.    Import('');  {No prompt this time; Import remembers the name.}
  343.    Invert
  344.    SetScaling ('Bilinear');
  345.    SetScaling ('New Window');
  346.    ScaleAndRotate (0.80, 1.0, 0);
  347. end;
  348.  
  349.  
  350. macro 'Import 64x64x64x16-bit SPECT Image…';
  351. {Imports a 64x64x64x16-bit headerless SPECT image into a stack.}
  352. var
  353.   width,height,nImages,hdrsize:integer;
  354. begin
  355.   RequiresVersion(1.50);
  356.   width:=64;
  357.   height:=64;
  358.   nImages:=64;
  359.   HdrSize:= 0;
  360.   SetImport('16-bit Unsigned, Swap Bytes');
  361.   {SetImportMinMax(0,2500);} {Uncomment to fix scale}
  362.   SetCustom(width,height,HdrSize,nImages);
  363.   Import('');
  364.  end;
  365.  
  366.  
  367. macro 'Import 8-bit 3D Image…';
  368. var
  369.   width,height,offset,nImages:integer;
  370. begin
  371.   RequiresVersion(1.50);
  372.   width:=GetNumber('Width:',256);
  373.   height:=GetNumber('Height:',256);
  374.   nImages:=GetNumber('Depth(number of slices):',128);
  375.   offset:=GetNumber('Offset(header size):',0);
  376.   SetImport('8-bit'); 
  377.   SetCustom(width,height,offset,nImages);
  378.   Import('');
  379. end;
  380.  
  381.  
  382. macro 'Open with scale set to 100 pixels/mm [S]';
  383. {Example of a way to open images and have the}
  384. {spatial scale always set the same way.}  
  385. begin
  386.   Open('');           {or Import('')}
  387.   SetScale(100,'mm'); {Change as needed}
  388. end;
  389.  
  390.  
  391. macro 'Load Synergy Image';
  392. begin
  393.    SetImport('8-bit'); 
  394.    SetCustom(512,480,16384);
  395.    Import('');
  396.    ChangeValues(0,0,1);
  397.    ChangeValues(255,255,254);
  398.    SetPalette('Rainbow');
  399. end;
  400.  
  401.  
  402. macro 'Import Siemens 3D MRI…';
  403. begin
  404.   RequiresVersion(1.50);
  405.   SetImport('16-bit Signed, Swap Bytes');
  406.   {SetImportMinMax(0,3000);} {Remove comments to fix scale}
  407.   SetCustom(256,256,0,127);
  408.   Import('');
  409. end;
  410.  
  411.  
  412. procedure ImportPhotoshop(offset:integer);
  413. {
  414. Imports a 24-bit, uncompressed Photoshop
  415. TIFF file into a 3-slice stack.
  416. }
  417. var
  418.   width,height,temp,stack,i,j:integer;
  419. begin
  420.   SetImport('8-bit; Invert');
  421.   width:=GetNumber('Width:',512);
  422.   height:=GetNumber('Height:',512);
  423.   SetCustom(3*width,height,offset,1);
  424.   Import('');
  425.   temp:=PicNumber;
  426.   SetNewSize(width,height);
  427.   MakeNewStack('RGB');
  428.   AddSlice;
  429.   AddSlice;
  430.   stack:=PicNumber;
  431.   for i:=0 to width-1 do begin
  432.     for j:=1 to 3 do begin
  433.       ChoosePic(temp);
  434.       GetColumn(3*i+(j-1),0,height);
  435.       ChoosePic(stack);
  436.       ChooseSlice(j);
  437.       PutColumn(i,0,height);
  438.     end;
  439.   end;
  440.   SelectSlice(1);
  441.   SelectPic(temp);
  442.   Dispose;
  443. end;
  444.  
  445. macro 'Import Photoshop 2.0 24-bit TIFF';
  446. begin
  447.   ImportPhotoshop(196);
  448. end;
  449.  
  450. macro 'Import Photoshop 2.5 24-bit TIFF';
  451. begin
  452.   ImportPhotoshop(598);
  453. end;
  454.  
  455. macro 'Import LUT…';
  456. {Imports a 256 x 3 x 8-bit look-up table located 'offset'
  457.  bytes from the beginning of a file. Use an offset of 32 for
  458.  LUTs created using Image's Save As command and an
  459.  offset of 0 for Exported LUTs.}
  460. }  
  461. var
  462.   offset,i:integer;
  463. begin
  464.   offset:=0; {Use 32 for LUTs created using Save As}
  465.   SetImport('8-bit'); 
  466.   SetCustom(256,3,offset);
  467.   Import(''); {Read LUT as an image}
  468.   for i:=0 to 255 do begin
  469.     RedLut[i]:=GetPixel(i,0);
  470.     GreenLut[i]:=GetPixel(i,1);
  471.     BlueLut[i]:=GetPixel(i,2);
  472.   end;
  473.   UpdateLUT;
  474. end;
  475.  
  476. macro 'Open List of Files…';
  477. var
  478.   width,height:integer;
  479.   name,ch:string;
  480. begin
  481.   width:=256;
  482.   height:=3;
  483.   SetCustom(width,height,0);
  484.   Import('File List'); {Read text as an image}
  485.   repeat
  486.     name:='';
  487.     repeat
  488.        ch:=chr(GetPixel(CharLoc mod width,CharLoc div width));
  489.        if ch>=chr(32) then begin
  490.          name:=concat(name,ch);
  491.        end;
  492.        CharLoc:=CharLoc+1;
  493.      until (ch=13) or (CharLoc>=width*height);
  494.      ShowMessage(name);
  495.      wait(1);
  496.   until (name='') or (CharLoc>=width*height);
  497. end;
  498.  
  499. macro 'File processing test';
  500. begin
  501.   Open('hd400:images:image001');
  502.   Invert;
  503.   Save;
  504.   Close;
  505.   Open('hd400:images:image002');
  506.   Invert;
  507.   Save;
  508.   Close;
  509.   Open('hd400:images:image003');
  510.   Invert;
  511.   Save;
  512.   Close;
  513. end;
  514.  
  515. macro 'Batch Processing Example…';
  516. {
  517. Reads from disk and processes a set of images too large to
  518. simultaneously fit in memory. The image names names must be
  519. in the form 'image001', 'image002', ..., but this can be changed.
  520. }
  521. var
  522.   i:integer;
  523. begin
  524.   for i:=1 to 1000 do begin
  525.       open('image',i:3);
  526.      {process;}
  527.       save;
  528.       close;
  529.    end;
  530. end;
  531.  
  532.  
  533. macro 'Export Non-Rectangular ROI';
  534. var
  535.   left,top,width,height:integer;
  536.   pid1,pid2:integer;
  537. begin
  538.   GetRoi(left,top,width,height);
  539.   if width=0 then begin
  540.      PutMessage('Non-rectangular selection required.');
  541.      exit;
  542.   end;
  543.   pid1:=PidNumber;
  544.   SetNewSize(width,height);
  545.   MakeNewWindow('Temp');
  546.   pid2:=PidNumber;
  547.   SelectPic(pid1);
  548.   Copy;
  549.   SelectPic(pid2);
  550.   Paste;
  551.   Export; {or SaveAs}
  552. end;
  553.  
  554.